Сильный нагрев процессора на плате HDD при запуске ОС не с этого HDD. А при запуске "своей" ОС, HDD греется слабо

[blabla 63]

Нуу, вообще плата диска слабо контактирует с корпусом, иногда даже поролоновые прокладки можно встретить. Если диск греется в простое, возможно, его контроллер работает некорректно. Нормальный диск в простое паркует головки и останавливает моторчик и сам не нагревается. Контроллер в простое тоже сильно греться не должен. Тут надо принять во внимание, что диск может умереть в любой момент, а стоимость диагностики и ремонта будет выше покупки нового диска... Прошивать диск, который некорректно работает я бы тоже не стал.

Как вариант, я бы попробовал отключить парковку головок, чтобы диск всё время работал. Попробуйте wdidle3. Я сам не проверял работу, не могу ничего про это сказать.

Вот видео, там под ним ссылки на файлы.

Если корпус диска слишком греется, значит в корпусе он не обдувается. В старых/дешевых корпусах обычно предусмотрен обдув зоны с жесткими дисками передним вентилятором.